元初四年，征入为太仆，升太常官。太常与太仆都是三公九卿之一。太常是管礼仪祭祀。太仆是管车马。都是中央政府比较重要的职位。当时的博士官人才选拔搞弄虚作假和暗箱操作，没有为政府选拔真正的人才出来。杨震举荐著名学者陈留人杨伦等，让知识界的学术知识得以发扬光大，很多儒家学派的知识分子都称赞杨震推荐的人才好。永宁元年，替代刘恺为司徒官。当时的三公是“太尉、司徒、司空。”司徒掌人民事。邓太后死了后，内宠开始骄横起来，安帝的乳母王圣，利用皇帝的信任，搞起腐败起来。杨震向皇帝进谏言，指出信任内宠让其搞腐败会破坏法律制度，会动摇政府的执政基础。但是皇帝没有听他的。延光二年，替代刘恺当太尉。皇帝的舅舅九卿之一大鸿胪耿宝推荐中常侍李闰兄给杨震，让杨震关照关照。杨震不从。耿宝还亲自求杨震，还说这是皇帝的意思，要杨太尉遵守皇帝的意思就行了。但是杨震以遵守国家法律制度为由，不准。耿宝怀恨而去。皇后娘娘哥哥执金吾阎显也推荐亲朋好友让杨震关照当官，杨震也照拒不误。
司空刘授就做老好人，把杨震拒绝的两个人都任以要职。于是那些皇亲贵戚对杨震都恨之入骨起来。心里都认为这姓杨的，太不给面子了。安帝派使者为乳母王圣修府第，中常侍樊丰、侍中周广、侍中谢恽等更相煽动，倾摇朝庭，支持动用国库财政为王圣大修府第。杨震又上谏说，要皇帝惜民财，去奸幸。但是汉安帝不理睬这些谏言。杨震利用地震的灾难规劝安帝。汉安帝心中对杨震不满起来，太监樊丰等奸幸都恨杨恨得要死，但因杨震是全国著名的知识分子，当世名儒，因此奸臣们不敢加害。河间有一血性男子赵腾向皇帝上书，指陈得失，皇帝把恨气发泄到了这个枉死鬼身上。杨震上言想要救这男子，但是汉安帝跟杨震积怨已深，赵腾还是伏尸都市。
会三年春，汉安帝东巡岱宗。樊丰等奸臣乘着皇帝出行在外，利用公款，攀比似地建设豪华府第，杨震的下属高舒召大匠令史进行调查了解，得樊丰等的假诏书。准备向皇帝报告此事，但是皇帝还在巡视地方。樊丰因为是假借皇帝命令动用国库财政，违规装修自己的房屋，都很害怕，正好有太史言星变逆行，于是利用古人迷信，害怕上天降下灾难的心理，陷害太尉杨震，说是杨震做了某种坏事，使上天要降下灾难。又说杨震对赵腾的事耿耿于怀，怨恨皇帝，还说杨震是邓骘的门生故吏，对皇帝的怨恨更深了一层。皇帝车驾还朝的时侯，要使者用计策没收了杨震的太尉官印。杨震于是柴门谢绝宾客，怕一些无辜的人受牵连。樊丰等又雪上加霜地陷害杨震，请任大将军的耿宝打杨震的小报告，说杨震不服罪，还存有对皇帝的怨恨不满之心。最后，皇帝下诏遣送杨震回老家。杨震在京城城西夕阳亭时，对儿子们还有门人故吏们说，死对知识分子来说是一种常事，我受国家的恩情当上太尉一职，但是奸臣贪官没有诛杀，受宠信的太监与女人们的恶行我没有能禁止，我有何面目还活在这人世间！我死时只用杂木为棺，布单遮体就行了，不要建祠，不要搞豪华坟墓。说后喝鸩酒自杀。樊丰等还指示弘农太守使坏，让杨震的棺露于道路上，还迫害杨震几个儿子。让很多观望的老百姓滴下了同情的泪水。
