第二赛段从圣罗莎拉潘帕到圣拉斐尔，赛段距离295公里，行驶路段487公里。赛段中设有四个CP点和一个加油点。当天参加摩托车组比赛的车手有177人，首个赛段斩获赛段冠军的智利车手勒普兹于当地时间上午5点从起点大营率先发车，科马和皮佐里托等紧随其后。当天的赛段开始部分是由速度较快并且宽阔的路面组成，但是在170公里以后的路段就开始变得狭窄多弯并且遍布碎石。赛段的最后一个部分是由火山灰构成的灰色沙漠地形组成风力较大。
卫冕冠军科马在当天的节奏依旧稳定，不过在比赛的第一个高速路段他只能跟住勒普兹的Aprilia赛车，在体现车手控车技术的沙漠路段科马超越了对手并在冲过终点之后取得了领先，西班牙人完成比赛后领先德普雷1分18秒。
“今天这个赛段一开始的部分速度非常快，而勒普兹和我都是以全速行驶，他的赛车非常非常快。在那之后我们来到了赛段的第二个部分主要以沙漠为主，这样的路段很考验车手技术和辨别方向的能力，我在这个路段取得了领先并且最终保持住了，因此今天对我来说很棒，”科马赛后表示。
和对手相比，第13位发车的德普雷在高速赛段不断地超车，而他也感谢其他车手及时地给他了超越空间。排在第三位的西班牙车手波特落后2分33秒，他的表现令人惊讶。而首个赛段领跑的勒普兹排在第四，他在赛后表示并未开始考虑总成绩只是希望能够跟住对手。
分列五到六位的车手是普利兹刚斯琪和加斯图。值得一提的是比赛开始以后KTM车手法利亚在赛段4公里处赛车停了下来，但是随后他又再度回到比赛中去。而美国车手斯雷特在234公里处赛车机械故障并且无法独立完成修复面临退赛。
第二赛段结束之后摩托车组总成绩方面科马用时3小时40分12秒取得领先，勒普兹落后2分30秒，德普雷落后2分52秒分列二三。结束第二赛段之后，车手们将在当地时间1月3日从圣拉斐尔出发前往圣胡安，赛段里程数270公里，行驶路段291公里。
