电喷系统是一个精密而复杂的系统，对发动机的运转性能有很大的影响，不论是该系统的ECU、控制线路还是其它任何一个传感器、执行器出现故障，都会在一定程度上影响发动机的起动性、运转稳定性、动力性、经济性等。
而造成电喷发动机不工作或工作不正常的原因可能是电子控制系统，也有可能是电子控制系统以外其它部分的问题，也可能是机械方面的；而且不同车型的电喷系统往往有很大的差异，故障检查的难易程度也不一样，因此给故障的检查与排除带来一定的困难。
如果我们能够遵循电喷摩托车故障诊断的一些基本原则，故障的诊断与排除便可迎刃而解。电喷摩托车故障诊断排除的基本原则可概括为以下几点。
1、先外后内
在发动机出现故障时，先对电子控制系统以外的可能故障部位予以检查。这样可避免本来是一个与电子控制系统无关的故障，却对系统的传感器、ECU、执行器及线路等进行复杂且又费时费力的检查，即真正的故障可能是较容易找到却未能找到。
以进气系统为例，ECU主要根据空气流量计测得的空气流量或进气管压力传感器测得的进气歧管压力来控制喷油量，因此进气系统密封不严而漏气会导致发动机失调，造成怠速不稳、易熄火、动力性和加速性变差，对系统的影响程度要比化油器式发动机要大得多。
诊断进气系统故障时，首先应按未装电控元件的基本诊断程序进行检查排除；如故障仍未排除，并确认是进气系统发生了故障时，首先应拆除空气滤清器，进行目测检查，排除一些一般性故障因素。
检查的内容包括如下项目：
（1）检查空气滤清器滤芯及其周围是否有脏物、杂质或其它污染物，必要时更换。
（2）检查进气管是否破裂、漏气、老化或挤坏。
（3）检查各传感器与电脑的连接电线束是否松动或断开，电线是否有磨破或线间短路、断路的现象，电线插接头是否插接就位，有无腐蚀现象等。
（4）检查各传感器是否有明显的损伤。
2、先简后繁
能以简单方法检查的可能故障部位先予以检查。比如直观诊断最为简单，我们可以用看、摸、听等直观检查方法将一些较为显露的故障迅速地找出来。
直观诊断未找出故障，需借助仪器仪表或其它专用工具来进行诊断时，也应对较容易检查的先予以检查。
3、先熟后生
由于电喷系统的构造和工作原理比较复杂，不同车型的电喷系统往往有较大的差异，在检查与排除电喷系统的故障时，必须了解各电喷系统的工作原理和构造特点，参阅需修车型的详细技术资料。
4、代码优先
由于电喷系统愈来愈复杂，当发生故障时要判断故障的部位就更困难。为方便检修，现代电喷摩托车一般都有故障自诊断功能。
当电喷发动机运行时，故障自诊断系统监测到故障后，便以代码的方式将该故障储存到电脑的存储器内，同时通过警告灯向骑手报警。
因此，检修时应优先借助于ECU的故障诊断接口（插座），按特定的程序用人工跨接的方法或使用故障诊断仪，将ECU存储器中的故障代码调出，并以灯光闪烁的方式或直接由诊断仪显示屏以数字形式显示出来，从而帮助维修人员快速正确地判断故障的类型和范围。
待故障代码所指的故障消除后，如果发动机故障现象还未消除，或者开始就无故障代码输出，则再对发动机可能的故障部位进行检查。
故障排除后，同样按特定的程序，用人工方法或借助于诊断仪，将存储在ECU存储器中的故障代码清除掉，以便记录和存储新故障码。
如果不清除旧的故障码，当发动机再次出现故障后，ECU把新旧故障码一并输出，使得维修人员不知道哪些是发动机真正存在的故障，哪些是以前已经排除的故障，使新旧故障代码混淆，给检修带来困难。
5、先思后行
众所周知，乱拆瞎碰，只能将小故障变成大故障，甚至造成无法挽回的状况，带来不应有的损失。因此，必须首先对发动机的故障现象进行故障分析，了解可能的故障原因有哪些，然后再进行故障检查。只有这样才可避免故障检查的盲目性：既不会对与故障现象无关的部位做无效的检查，又可避免对一些有关部位漏检而不能迅速排除故障。
6、先备后用
电喷系统的一些部件性能好坏，电气线路正常与否，常以其电压或电阻等参数来判断。如果说没有这些数据资料，系统的故障检查将会很困难，往往只能采取新件替换的方法，这些方法有时会造成维修费用猛增且费工费时。
因此在检修时，应准备好维修车型的有关检修数据资料。除了从维修手册、专业书刊上收集整理这些检修数据资料外，另一个有效的途径是利用无故障车辆对其系统的有关参数进行测量，并记录下来，作为日后检修同类型车辆的检测比较参数。如果平时注意做好这项工作，会给电喷系统的故障检查带来方便。
特别注意：电喷发动机的故障并非一定出在电喷系统。如果发现发动机有故障，而故障警告灯并未点亮（未显示故障代码），大多数情况下，该故障可能与电喷系统无关，此时，就应该像发动机没有装电喷系统那样，按照基本诊断程序进行故障检查。
否则，可能遇到一个本来与电喷系统无关的故障，却检查电喷系统的传感器、执行器和电路等，花费了很多时间，而真正的故障反而没有找到。
